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RNA水平检测
（一）转录组
转录组在广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA；在狭义上是指所有mRNA的集合。
1. 检测方法
Ø 转录组测序
转录组测序是基因结构和功能研究的基础。针对不同种类的RNA，可采用不同的方法进行分离和富集，然后进行测序。mRNA与lncRNA见图8。
图8. 转录组样品制备与测序流程
2. 应用领域
Ø 疾病分型研究；
Ø 分子标志和药物靶点的筛选；
Ø 药理与病理学研究；
Ø 功能基因组筛选；
Ø 生物代谢调控研究
3. 我们的优势
Ø 重复性好；
Ø 数字信号；
Ø 检测精度高，从几个到几十万个拷贝；
Ø 分辨率高，可以检测单个碱基差异。
（二）小RNA
小RNA是生物体内一类重要的特殊分子，以RNA干扰、翻译抑制、异染色质形成等基因沉默方式调控生长发育、应激反应等多种多样的细胞进程。许多疾病的发生、发展都与小RNA的调控密切相关。
1. 检测方法
Ø 小RNA测序
二代测序省去了小RNA克隆文库的构建过程，可以一次性产生上百万条小RNA序列，能够快速鉴定特定条件下表达的已知小RNA并发现新的小RNA，同时还可以研究不同条件下小RNA的表达差异。
Ø 微小RNA（microRNA，miRNA） 芯片
miRNA芯片的检测原理是：用Cy-3对总RNA样品进行标记，然后与miRNA芯片杂交，通过扫描芯片上绿光信号的强度，计算出该样品中miRNA的表达量，从而了解该样品中哪些miRNA的表达量出现了异常。原理图见图9，测序流程见图10。
图9. miRNA的检测原理
图10. miRNA测序流程
2. 应用领域
Ø 疾病致病机制研究；
Ø 靶基因功能研究；
Ø 肿瘤研究；
Ø 药物药理研究；
Ø 生物标志物筛选；
Ø 发育进化研究。
3. 我们的优势
Ø 高通量：一次测序得到的序列可以达到千万左右；
Ø 可拓展性：可以鉴定未知新小 RNA；
Ø 重复性良好：深度测序保证了检测的随机性，重复性好；
Ø 高分辨率：可以检测到单个碱基差异。
沪公网安备 31010402003982号
