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芯片技术服务

DNA甲基化芯片

 DNA甲基化检测芯片是一种将DNA甲基化分析与基因芯片结合起来的高通量检测技术,可以对DNA甲基化进行定性和定量分析。

 

1. 应用领域

Ø 癌症研究

Ø 染色体结构稳定性研究

Ø 基因表达差异研究

Ø X-染色体失活

Ø 疾病发生及进展

Ø 细胞分化

Ø 发育

 

2. 我们提供的甲基化芯片技术特点

Ø 多种检测芯片型号:包括全基因组、启动子和定制芯片。全基因组DNA甲基化芯片设计涵盖了人类、小鼠、大鼠和植物基因组的非重复区域,其分辨率在100bp-255bp。

Ø 高分辨率和高通量:Roche NimbleGen具有目前市场上密度高的DNA甲基化芯片平台,提供四种格式的芯片:2.1M(单张芯片上210万探针)、3×720K(每张芯片3样本每样本72万探针)、385K(单张芯片38.5万探针)以及4×72K(每张芯片4样本每样本7.2万探针)。密度2.1M芯片只需要10张就能以100bp的分辨率覆盖人类基因组所有非重复区域。

Ø 高灵敏度和特异性:Roche NimbleGen芯片探针使用光敏合成50-75mer的长探针,使  其具有敏感性和特异性。使用的双色荧光系统,可消除芯片批次间的差异。

Ø NimbleGen DNA甲基化芯片能稳定地检测最低500bp内的两个甲基化CpG岛。

Ø 图形化显示结果:Roche NimbleGen开发了SignalMap软件,可以非常直观地显示芯片结果,标识出高甲基化区域。

 

检测原理

  样本通过MeDIP或者MBD方法来富集甲基化区域,得到的DNA片段用Cy5和Cy3双色荧光标记分别标记IP Sample和Input Sample,之后与NimbleGen DNA甲基化芯片杂交来进行检测。见图19

 

19. DNA甲基化检测芯片工作原理

 

 

“实验报告内容简介”

“芯片技术服务平台介绍”

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