芯片技术服务

ChIP-on-chip芯片

ChIP-on-chip是研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细胞状态下把细胞内的蛋白质和DNA交联，超声波将其随机打断为一定长度范围内的染色质小片段，然后用所研究的目的蛋白质特异性抗体免疫沉淀蛋白质-DNA复合体，从而特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段。

1. 应用领域

Ø 蛋白与DNA相互作用

Ø 转录因子和聚合酶的DNA结合位点研究

2. 我们提供的ChIP-on-chip芯片服务

       根据客户需要可以提供以下厂家的ChIP-on-chip芯片服务。

我们提供的ChIP-on-chip芯片具有极高的灵敏度。这类芯片能快速地定位特定蛋白与DNA结合的区域，例如转录因子、组蛋白和聚合酶。基于该平台，科学家们已经获得并发表了许多重要的科研成果。

技术特点

Ø 型号多样：我们提供覆盖全基因组、启动子和设计定制的ChIP-on-chip芯片。NimbleGen的全基因组ChIP-on-chip探针覆盖了人类、小鼠、拟南芥、大鼠、狗、鸡、蠕虫、苍蝇、酵母和大肠杆菌基因组的非重复区域，分辨率小于100bp，可用来探索启动子/增强子、转录因子结合、组蛋白修饰/替换和Dnase-I超敏感性。

Ø 高分辨率和高通量：2.1M芯片（单张芯片上210万探针），3×720K芯片（每张芯片3样本每样本72万探针），385K芯片（单张芯片38.5万探针），4×72K芯片（每张芯片4样本每样本7.2万探针）。根据实验需求，可以选择高密度高耗费的2.1M芯片，也可以选择低密度更低耗费的其它芯片。

Ø 高灵敏度和特异性：使用光敏合成50-75mer的长探针，使其具有敏感性和特异性。双色荧光系统可消除芯片批次间的差异。可以稳定地检测到2倍丰度的目标结合位点。

Ø 图形化显示结果：Roche NimbleGen开发了SignalMap软件，可以直观地显示芯片结果，标识出DNA-蛋白结合区域。

检测原理

   通过染色质免疫沉淀（chromatin immunoprecipitation）方法来富集DNA与蛋白结合区域，得到的DNA片段用Cy5和Cy3双色荧光标记分别标记IP Sample和Input Sample，之后与NimbleGen ChIP-on-chip芯片杂交来检测DNA与蛋白结合位点。见图18。

图18. ChIP-on-chip的检测原理

“实验报告内容简介”

“芯片技术服务平台介绍”